Мұз дәуірі кезінде, шамамен 25000 жыл бұрын, мұздық түсіп, Валдай тауларын төбелерімен бірге жасады. Алынған шұңқырлар еріген сумен толтырыла бастады, әйгілі Селигер көлі дүниеге келді. Көлдің мөлдір сулары бар, бұл оның атына сәйкес келеді, ол фин тілінен аударғанда «селея» «таза, мөлдір» дегенді білдіреді.
Көл сондай-ақ орналасқан аралдардың санымен таң қалдырады, оның шамамен 169 бөлігі бар. Олардың көпшілігінің ауданы онша үлкен емес (диаметрі 10 метрге жуық), бірақ ең үлкені - Хачин аралы, онда 13 жеке көл бар.
Әр түрлі аралдарымен таңғажайып Селигер көлі туралы керемет және әдемі аңыз қалыптасты. Аңыз өте ерте заманда жер бетінде Ильмен мен Селигер бауырлас көлдердің өмір сүргендігі туралы айтады. Ағайындылардың өздері жақсы көретін Еділ апасы болған. Еділ қалай болғанда да оның ұлылығын естіген Каспий теңізін көрсетуді өтінді. Бауырлар одан бас тарта алмады және бұл тілекті орындаймыз деп уәде берді. Олар жорыққа жиналды, бірақ жоғалып кетпеу және жоғалып кетпеу үшін бәрін бірге және тек күндізгі уақытта баруға келісті. Осылайша олар бірнеше күн жүрді. Бірақ бір түні Ильменнің ағасы оянып, Селигердің ағасы оны алдап, қарындасымен жасырын кетіп қалғанын көреді. Ильмен бауырым мұндай сатқындыққа ашуланып, оны келесі сөздермен алдап кеткені үшін қарғады: «Ей, маған опасыздық жасаған Селигер бауырым, сенің опасыздығың үшін мен сені қарғам! Сондықтан сіздің артыңызда жүз өркеш болсын! « Құдайлар оны естіді және Селигердің антын бұзғаны үшін олар ағасының қарғысын орындады. Содан бері Селигер осындай өркешті аралдарды киіп келді.
Бүгінде көлдің жағалау сызығы 590 шақырымды құрайды. Акватория 260 шаршы шақырымды құрайды. Селигердің үлкен және кіші созылыстары бар, олар бұғаздармен байланысты. Plyos - бұл аралдар арасында орналасқан салыстырмалы түрде үлкен су айдыны.
Көлдің бұғаздары да бар, ал тар өзендер ағынды, ал үлкендері өзендер деп аталады. Төгілгендердің жалпы саны - 23. Көлдің түбі құмды. Көлде орналасқан таяздардың көптігіне байланысты оған тек шағын қайықтар жүзе алады, бірақ тереңдігі 30 метр болатын үлкен ойпат бар.
Көлдің өзі және оның айналасындағы табиғат көріністері көз тартарлық әсемдікке толы, сондықтан бұл жерді көруге тұрарлық.
